More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3079 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 312 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  97.31 
 
 		 297 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  69.71 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  55.37 
 
 		 325 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  56.73 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  45.52 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  44.8 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  45.71 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  42.97 
 
 		 354 aa  228  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  46.38 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  44.29 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  42.26 
 
 		 350 aa  221  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  41.88 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.71 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  39.64 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  43.88 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  42.03 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  37.99 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.3 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  38.3 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  38.3 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  40.15 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  40.15 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  38.95 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  36.67 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  39.65 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  36.49 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  33.86 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  31.29 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  30.95 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  31.05 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  29.29 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  29.37 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  30.39 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  31.56 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  25.98 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.85 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.77 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 337 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.4 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.3 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.3 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 340 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.57 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.21 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.25 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.21 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.21 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  23.79 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  29.67 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.21 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  30 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.82 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  28.52 
 
 		 354 aa  89  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  28.9 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  28.01 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  32.35 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 662 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  26.43 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.03 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  29.96 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  31.41 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.98 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  28.75 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  29.6 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  29.52 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  23.47 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  28.73 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.55 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.4 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.33 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.33 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.33 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.31 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.33 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.33 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  25.35 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  25 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  31.02 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.28 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>