More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1806 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  100 
 
 
358 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  44.37 
 
 
305 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  43.84 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  40.07 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  35.48 
 
 
317 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  34.02 
 
 
662 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.4 
 
 
321 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.38 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.38 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.56 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.72 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.56 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.87 
 
 
321 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.87 
 
 
321 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  30.56 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  30.03 
 
 
321 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  32.86 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
324 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  28.33 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  28.33 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  28.33 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  28.33 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  27.42 
 
 
320 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  31.27 
 
 
319 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  29.32 
 
 
324 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  28.52 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  27.67 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  27.48 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  26.58 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  27 
 
 
320 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  28.04 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  30 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  29.96 
 
 
346 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.73 
 
 
312 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.73 
 
 
312 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  28.96 
 
 
313 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  27.78 
 
 
314 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
310 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.42 
 
 
314 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.42 
 
 
314 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.42 
 
 
314 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.43 
 
 
311 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.42 
 
 
314 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  30.97 
 
 
298 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
300 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  27.43 
 
 
314 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
323 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.42 
 
 
314 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  28.18 
 
 
312 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27 
 
 
314 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
340 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  27.5 
 
 
314 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.74 
 
 
314 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  28.21 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  26.74 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.74 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  26.74 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  26.74 
 
 
314 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  36.84 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  36.84 
 
 
330 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  29.17 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.93 
 
 
298 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
316 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  27.34 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  26.81 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.87 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  28.38 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.82 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  27.6 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.98 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  25.9 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09740  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  37.58 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.249331  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.55 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.09 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  29.74 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.89 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  28.97 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  28.29 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.49 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  25.08 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  26.19 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  34.42 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  29.44 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.76 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.76 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.27 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.42 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.95 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  34.59 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  26.86 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  26.86 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.86 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  29.58 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.89 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>