180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3702 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  100 
 
 
329 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  66.67 
 
 
335 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  59.88 
 
 
335 aa  364  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  44.84 
 
 
337 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  44.54 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  45.72 
 
 
337 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  44.54 
 
 
337 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.95 
 
 
337 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  45.05 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.53 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.66 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.66 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  54.76 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  43.86 
 
 
340 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  50.47 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  45.28 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  43.4 
 
 
339 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  43.95 
 
 
337 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  34.82 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
316 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  28.92 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  32.53 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  28.92 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
316 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  31.72 
 
 
314 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
315 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  31.35 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
321 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  26.42 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  34.24 
 
 
340 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.22 
 
 
309 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  30.92 
 
 
327 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  28.34 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  28.34 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  30.52 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.22 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  29.29 
 
 
341 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  31.69 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  29.77 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  31.76 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  31.79 
 
 
301 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  25.15 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  30.51 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.55 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.74 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  22.05 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  30 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  24.08 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  24.55 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  29.97 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  23.84 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  27.43 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  23.9 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.42 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  29.1 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  25 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  25 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  34.46 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  32.64 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  32.64 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.47 
 
 
361 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.28 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  25 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  30.81 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  29.82 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.57 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  24.11 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  22.58 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  31.69 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  28.98 
 
 
314 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.96 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  26.94 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  27.62 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  29.88 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.04 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.04 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.04 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  31.16 
 
 
314 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  24.39 
 
 
316 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  29.82 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.28 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  30.66 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.28 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.66 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.66 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>