More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0151 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  100 
 
 
296 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  34.47 
 
 
309 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  34.6 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  35.18 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  35.18 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  35.18 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  35.18 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  35.14 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  35.18 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  32.73 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.98 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.59 
 
 
303 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.99 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  31.66 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  31.73 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.99 
 
 
296 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  33.86 
 
 
259 aa  162  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  30.61 
 
 
295 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  32.57 
 
 
292 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  33.6 
 
 
296 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.6 
 
 
296 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  33.6 
 
 
296 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  33.6 
 
 
296 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.6 
 
 
296 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.6 
 
 
296 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.6 
 
 
296 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.6 
 
 
296 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  32.64 
 
 
319 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  32.53 
 
 
309 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  33.59 
 
 
308 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  27.9 
 
 
317 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  32.71 
 
 
301 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
323 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  30.68 
 
 
277 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
300 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  29.18 
 
 
312 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  30.67 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  30.24 
 
 
363 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
352 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  29.62 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  31.14 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  30.86 
 
 
335 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.38 
 
 
324 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  30 
 
 
324 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  30.94 
 
 
323 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  28.74 
 
 
274 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.03 
 
 
324 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.97 
 
 
324 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.97 
 
 
324 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.97 
 
 
324 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.97 
 
 
324 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0088  periplasmic binding protein  27.48 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1439  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, periplasmic siderophore binding protein  27.59 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0617961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1140  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
316 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.68 
 
 
332 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6720  periplasmic binding protein  25.38 
 
 
291 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1103  periplasmic binding protein  26.79 
 
 
325 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4122  periplasmic binding protein  27.99 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  26.3 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
330 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4272  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  26.59 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0321448  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2777  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
351 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  27.65 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  28.03 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.08 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  25.18 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.54 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  23.71 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  25.87 
 
 
662 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  34.19 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  26.13 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  25.18 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  27.54 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  26.12 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  25 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  42.31 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  27.3 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
341 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  32.92 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  25.44 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  25.44 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  25.44 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  23.67 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  26.62 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.41 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  23.13 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.41 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  24.6 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  23.21 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  23.57 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  23.57 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  29.58 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  30.92 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>