58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2231 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  100 
 
 		 273 aa  528  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  43.08 
 
 		 631 aa  184  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  40.46 
 
 		 424 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  38.86 
 
 		 452 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  35.29 
 
 		 484 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  38.62 
 
 		 428 aa  105  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  34.22 
 
 		 618 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.69 
 
 		 1679 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  34 
 
 		 401 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  37.99 
 
 		 1389 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  28.64 
 
 		 581 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  32.29 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  33.54 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  31.03 
 
 		 816 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  27.93 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  31.43 
 
 		 586 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  34.64 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1059 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  26.12 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  34.12 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.97 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  33.16 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  36.69 
 
 		 581 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1085 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  25.79 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  36.62 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  28.14 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  28.14 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  28.48 
 
 		 450 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.38 
 
 		 755 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  29.19 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  29.05 
 
 		 765 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  35.51 
 
 		 416 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  37.84 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  27.88 
 
 		 2132 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.58 
 
 		 508 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  35.44 
 
 		 1266 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.3 
 
 		 1088 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  27.5 
 
 		 419 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  29.38 
 
 		 755 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  29.38 
 
 		 731 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  29.38 
 
 		 755 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  31.65 
 
 		 1780 aa  46.2  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.4 
 
 		 1070 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.4 
 
 		 1112 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.4 
 
 		 1070 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  33.14 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.9 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  33 
 
 		 531 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  29.55 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.61 
 
 		 713 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  31.82 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 867 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.56 
 
 		 1107 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.06 
 
 		 772 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  27.83 
 
 		 193 aa  42.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1351 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>