89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0701 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0701  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.320058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1654  ABC transporter, permease component  44.71 
 
 		 169 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  26.37 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  26.37 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.27 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.74 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.82 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  27.12 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  24.37 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.45 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.88 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 360 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  25.42 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.87 
 
 		 360 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0360  hypothetical protein  24.15 
 
 		 941 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0374  hypothetical protein  24.15 
 
 		 941 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  25.42 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  24.74 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  22.35 
 
 		 918 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  23.91 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  25.73 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  27.63 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  24.38 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0430  hypothetical protein  23.67 
 
 		 953 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0882227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 348 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0355  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 981 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0417  phage infection protein  23.67 
 
 		 991 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0346  hypothetical protein  23.67 
 
 		 941 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0484  hypothetical protein  23.67 
 
 		 953 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0350  hypothetical protein  23.67 
 
 		 953 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  27.63 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  21.71 
 
 		 930 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11020  YhgE/Pip-like protein  26.87 
 
 		 958 aa  45.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.458925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 269 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0473  phage infection protein  23.67 
 
 		 981 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.09 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 383 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0357  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 940 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  21 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24 
 
 		 384 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  23.84 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.84 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.34 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  22.52 
 
 		 936 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  24 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  25.81 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1639  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.62 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  28.49 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  25.42 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  23.84 
 
 		 381 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 367 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  20.82 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  21.67 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 266 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  27.22 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  23.78 
 
 		 922 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.95 
 
 		 244 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>