More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13412 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  34.06 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.65 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.58 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.23 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.76 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.61 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.9 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.12 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.9 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.54 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  40 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  26.4 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.19 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.17 
 
 
268 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.4 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.57 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.66 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.23 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.4 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.5 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 
232 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  30 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.74 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.76 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.76 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.63 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.27 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.54 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  25.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  25.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.8 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  25.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  29.95 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  25.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.42 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.22 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  25.12 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  29.05 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.18 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  30.43 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  35.24 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.94 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  29.33 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  23.65 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.54 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  27.19 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.41 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  23.72 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1167  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.484596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.21 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.13 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  25.51 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  31.47 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
234 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  27.67 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  27.87 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.5 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.51 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  27.02 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.85 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.56 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.83 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.42 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.13 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  24.45 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.36 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.6 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  23.94 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  22.66 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.07 
 
 
254 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.61 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>