More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13240 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  66.83 
 
 
203 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  63.11 
 
 
227 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  65.83 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  65.83 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  62.31 
 
 
203 aa  268  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 
202 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 
206 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  45.08 
 
 
206 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  43.82 
 
 
200 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  40.62 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  43.16 
 
 
191 aa  145  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 
194 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 
194 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  43.17 
 
 
195 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  43.17 
 
 
193 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
234 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  44.62 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  42.05 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  37.7 
 
 
196 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  42.7 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
189 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  40.68 
 
 
203 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  43.33 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 
193 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.92 
 
 
210 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  36.8 
 
 
238 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
190 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.16 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
193 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 
193 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
201 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  37.36 
 
 
201 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 
212 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  42.41 
 
 
240 aa  105  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
198 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
200 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
244 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  32.69 
 
 
236 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 
178 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  35.14 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35 
 
 
382 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
188 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.93 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.33 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.02 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  24.89 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.97 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.47 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.47 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.05 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.41 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
448 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  26.18 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
448 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.17 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.17 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25.76 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
449 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.53 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
402 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.95 
 
 
442 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>