More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2418 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  54.2 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  34.57 
 
 		 289 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1692  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1604  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  33.73 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  32.93 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  33.74 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2380  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2509  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123879  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  30.71 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3454  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.21 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.66 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 304 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4529  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1242  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.41 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  29.75 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5710  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5149  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  31.23 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2736  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  28.41 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  31.87 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  31.6 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4979  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.398741  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3170  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2430  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5738  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0329452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4567  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>