105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1932 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1932  glutamate--cysteine ligase, putative  100 
 
 		 380 aa  771    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0397  glutamate--cysteine ligase, putative  72.68 
 
 		 386 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22731  hypothetical protein  63.42 
 
 		 380 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20221  hypothetical protein  62.33 
 
 		 379 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.574897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1148  hypothetical protein  62.33 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16961  hypothetical protein  62.23 
 
 		 378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4608  glutamate/cysteine ligase  53.91 
 
 		 379 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00226206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3193  glutamate--cysteine ligase, putative  55.98 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0063813  hitchhiker  0.0000331865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4239  glutamate/cysteine ligase  53.76 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1668  hypothetical protein  49.05 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.589825  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2267  glutamate/cysteine ligase  54.79 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0192949  hitchhiker  0.000139542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2253  glutamate--cysteine ligase, putative  56.13 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.454832  normal  0.0496776 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17631  hypothetical protein  48.9 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17671  hypothetical protein  48.24 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2204  glutamate/cysteine ligase  54.52 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17831  hypothetical protein  49.32 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1837  glutamate/cysteine ligase  54.97 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0242  glutamate--cysteine ligase, putative  50.14 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419048  normal  0.0136203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0030  carboxylate-amine ligase  24.04 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4831  carboxylate-amine ligase  23.99 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4376  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.06 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4200  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.98 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0674  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.84 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.545446  normal  0.126463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5230  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.04 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0736  carboxylate-amine ligase  27.7 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0693  carboxylate-amine ligase  25.88 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5927  carboxylate-amine ligase  24.16 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777707  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0171  carboxylate-amine ligase  26.59 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3061  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.11 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  0.799076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16620  uncharacterized enzyme  26.67 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0681  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.92 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3891  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.02 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.892511  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4527  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.55 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3956  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.4 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2565  carboxylate-amine ligase  23.31 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1350  carboxylate-amine ligase  24.4 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2239  carboxylate-amine ligase  29.45 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0203  carboxylate-amine ligase  21.51 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0436  carboxylate-amine ligase  22.8 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.524992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4053  carboxylate-amine ligase  24.89 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00732082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0665  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.88 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0703  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.32 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4084  carboxylate-amine ligase  22.73 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29170  uncharacterized enzyme  24.26 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1802  carboxylate-amine ligase  23.94 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0573  carboxylate-amine ligase  23.45 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0585  carboxylate-amine ligase  23.45 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.670394  hitchhiker  0.00946283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0563  carboxylate-amine ligase  24.75 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2615  carboxylate-amine ligase  26.06 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2090  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.57 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  27.54 
 
 		 865 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2243  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.24 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0053932  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2510  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.7 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.643552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1316  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.71 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0440674  normal  0.42446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2462  carboxylate-amine ligase  24.16 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  27.49 
 
 		 861 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3163  carboxylate-amine ligase  25.81 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7205  carboxylate-amine ligase  27.14 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10438  carboxylate-amine ligase  26.21 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2903  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.19 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6659  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.88 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  decreased coverage  0.00571731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0405  carboxylate-amine ligase  26.24 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.047462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2274  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.87 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466886  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3073  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.8 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4415  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.29 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5940  carboxylate-amine ligase  22.47 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.111906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2601  carboxylate-amine ligase  22.18 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2970  uncharacterized enzyme  26.16 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3529  carboxylate-amine ligase  26.7 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0668  carboxylate-amine ligase  23.68 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0366  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.79 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.22419  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0652  carboxylate-amine ligase  23.2 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3862  carboxylate-amine ligase  28.24 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3394  protein of unknown function DUF407  24.51 
 
 		 850 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.8835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0952  carboxylate-amine ligase  29.1 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2891  carboxylate-amine ligase  21.95 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4045  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.66 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3384  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.79 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.122999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2071  glutamate--cysteine ligase GCS2  22.96 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3727  glutamate--cysteine ligase GCS2  24.79 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3646  carboxylate-amine ligase  26.57 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3311  uncharacterized enzyme  28.24 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0633  glutamate--cysteine ligase GCS2  28 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5402  glutamate--cysteine ligase GCS2  29.31 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.934684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2776  carboxylate-amine ligase  23.79 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5036  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.64 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2647  carboxylate-amine ligase  23.3 
 
 		 383 aa  46.2  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4105  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.84 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3930  carboxylate-amine ligase  23.83 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00266777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5194  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.41 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2114  carboxylate-amine ligase  31.03 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0002  carboxylate-amine ligase  23.83 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4596  glutamate--cysteine ligase GCS2  27.56 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0023216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2301  glutamate--cysteine ligase, GCS2  27.01 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3225  carboxylate-amine ligase  23.86 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1896  glutamate--cysteine ligase GCS2  26.89 
 
 		 357 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.961977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2699  glutamate--cysteine ligase GCS2  25.32 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2542  glutamate--cysteine ligase, GCS2  22.32 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2591  glutamate--cysteine ligase GCS2  23.36 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.24303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5146  glutamate--cysteine ligase GCS2  28.1 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>