More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1914 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  100 
 
 		 483 aa  963    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  76.4 
 
 		 480 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  64.48 
 
 		 488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  53.47 
 
 		 517 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.49 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.08 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.61 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.95 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.31 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  49.9 
 
 		 529 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.37 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17991  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.86 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.71 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.73 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  47.07 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.52 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.42 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 283 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  45.59 
 
 		 283 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  48.93 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  44.36 
 
 		 284 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  42.75 
 
 		 280 aa  203  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  47.27 
 
 		 287 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  43.3 
 
 		 283 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 283 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  44.79 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  46.46 
 
 		 224 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 300 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 		 281 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  44.95 
 
 		 225 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  43.5 
 
 		 225 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 225 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.09 
 
 		 232 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  45.95 
 
 		 232 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 225 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 225 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  45.56 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2515  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 		 285 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 283 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  43.14 
 
 		 283 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2240  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 285 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 281 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  48.39 
 
 		 273 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 283 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  39.3 
 
 		 281 aa  193  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2196  pantoate--beta-alanine ligase  46.06 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.941779  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 287 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  44.14 
 
 		 287 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  41.11 
 
 		 282 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  43.75 
 
 		 287 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  43.41 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  47.43 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.06 
 
 		 309 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  43.97 
 
 		 286 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  41.76 
 
 		 283 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  42.8 
 
 		 282 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  45.25 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 		 290 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.98 
 
 		 233 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  37.4 
 
 		 282 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  40.48 
 
 		 279 aa  188  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.13 
 
 		 283 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  44.14 
 
 		 226 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 		 282 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  45.32 
 
 		 289 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  40.08 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  44.05 
 
 		 283 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  46.03 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 276 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00689  pantoate--beta-alanine ligase  44.31 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.591476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 282 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  42.02 
 
 		 281 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  40.54 
 
 		 231 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 		 279 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  41.25 
 
 		 282 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 293 aa  186  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 240 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  41.27 
 
 		 281 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  41.09 
 
 		 277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  43.21 
 
 		 327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  39.13 
 
 		 281 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  43.53 
 
 		 285 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  39.69 
 
 		 280 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0886  cytidyltransferase-related  45.88 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000710708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.86 
 
 		 283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  40.08 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  48.44 
 
 		 224 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  47.04 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  43.08 
 
 		 283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  41.47 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  46.09 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>