68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2287 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  82.06 
 
 		 262 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  57.54 
 
 		 250 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  50.39 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  48.03 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  51.07 
 
 		 250 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  51.07 
 
 		 250 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  48.82 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  45.95 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  47 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  46 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  46.84 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  51.72 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  37.98 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  37.97 
 
 		 253 aa  156  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  45.36 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  44.62 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  44.9 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  46.39 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  39.83 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  42.56 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  39.01 
 
 		 549 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  39.5 
 
 		 705 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  32.48 
 
 		 1100 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  31.25 
 
 		 898 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 903 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 903 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  38.76 
 
 		 913 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  36.51 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  40.17 
 
 		 702 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  33.56 
 
 		 1132 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  38.6 
 
 		 300 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  34.23 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  33.33 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  33.59 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  32.42 
 
 		 1130 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  34.09 
 
 		 546 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  33.12 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  30.83 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35.9 
 
 		 983 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  32.8 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  39.02 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  31.65 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  30.67 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  32 
 
 		 289 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  29.27 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  33.59 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  31.45 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  29.32 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  32.8 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  32.79 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  30.56 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  30.22 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  29.5 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  29.86 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  29.86 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  30.95 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  28.31 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  27.78 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  29.17 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  29.27 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  29.23 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  30 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  28.33 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  28.33 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  29.51 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>