More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4767 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.99 
 
 		 1038 aa  853    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  54.47 
 
 		 1035 aa  1095    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1037 aa  2083    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  85.74 
 
 		 1036 aa  1780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  82.96 
 
 		 1037 aa  1673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  91.62 
 
 		 1038 aa  1876    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  44.3 
 
 		 1027 aa  830    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  76.53 
 
 		 1026 aa  1557    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  33.53 
 
 		 1092 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1064 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1042 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 		 1014 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  35.34 
 
 		 1054 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1051 aa  466  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1056 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1059 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1055 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1061 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1059 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1034 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1086 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1011 aa  350  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1034 aa  349  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.64 
 
 		 1024 aa  348  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.28 
 
 		 1049 aa  343  7e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1042 aa  341  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1082 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1048 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1043 aa  336  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1038 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1035 aa  336  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1158  cation/multidrug efflux pump-like protein  26.11 
 
 		 1009 aa  334  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1033 aa  333  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.93 
 
 		 1031 aa  333  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1031 aa  330  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1031 aa  330  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1051 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1051 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1031 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1037 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1051 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1036 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1095 aa  327  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1035 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1046 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1050 aa  325  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1047 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1044 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.23 
 
 		 1046 aa  322  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1047 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1047 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1047 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  26.79 
 
 		 1036 aa  320  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1031 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  26.79 
 
 		 1037 aa  318  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1023 aa  317  5e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1031 aa  317  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1031 aa  317  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1036 aa  317  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1044 aa  317  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1024 aa  316  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1042 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1046 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1058 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.33 
 
 		 1024 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1032 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1034 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1030 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 1496 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1036 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1071 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1074 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1027 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1042 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1060 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1069 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1041 aa  306  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1050 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1022 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1058 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.11 
 
 		 1034 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1040 aa  303  9e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1039 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1470 aa  303  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.94 
 
 		 1069 aa  301  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1053 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1062 aa  301  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1040 aa  301  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1054 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1054 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1054 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1029 aa  300  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1041 aa  300  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1055 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1031 aa  299  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1043 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1034 aa  298  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>