124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3837 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  65.49 
 
 		 537 aa  745    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  59.92 
 
 		 524 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  63.88 
 
 		 526 aa  712    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  62.17 
 
 		 522 aa  684    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  59.74 
 
 		 517 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  100 
 
 		 524 aa  1102    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  58.94 
 
 		 514 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  55.17 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  53.54 
 
 		 514 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  51.04 
 
 		 520 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  50.93 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  51.46 
 
 		 527 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  49.91 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  49.72 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  49.82 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  49.72 
 
 		 543 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  49.54 
 
 		 543 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  47.72 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  47.44 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  45.61 
 
 		 517 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  44.61 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  50.42 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  43.81 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  43.13 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  43.81 
 
 		 507 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  43.18 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  42.94 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  42.07 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  41.87 
 
 		 513 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  42.07 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.34 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  42.08 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  42.34 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  42.83 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  41.38 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  40.89 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  40.72 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  38.42 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  37.52 
 
 		 511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.21 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  37.22 
 
 		 537 aa  340  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.94 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.94 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.91 
 
 		 498 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  34.36 
 
 		 505 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  36.65 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  34.1 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.74 
 
 		 511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  34.1 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  31 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  36.31 
 
 		 499 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 508 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  35.83 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  33.9 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 497 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  35.25 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.12 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  29.58 
 
 		 529 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.23 
 
 		 507 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  29.58 
 
 		 529 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  37.63 
 
 		 504 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  35.71 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  34.61 
 
 		 512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  36.79 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  29.48 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.93 
 
 		 506 aa  231  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  31.98 
 
 		 510 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  29.1 
 
 		 538 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  29.1 
 
 		 538 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  29.24 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.71 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 502 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  29.68 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 504 aa  226  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  30.54 
 
 		 502 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  32.2 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  29.68 
 
 		 538 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 494 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 497 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  32.3 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  31.94 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.35 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  34.73 
 
 		 505 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  31.63 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 503 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.71 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  35.42 
 
 		 497 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  34.58 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.23 
 
 		 496 aa  217  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>