286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1738 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  54.61 
 
 		 307 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  52.4 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  46.77 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  44.85 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  43.89 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  44.7 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  47.97 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1407  allophanate hydrolase subunit 2  44.2 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  42.46 
 
 		 549 aa  234  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1499  allophanate hydrolase subunit 2  43.23 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0738135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  42.31 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4575  urea amidolyase related protein  41.46 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  42.31 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1314  urea amidolyase related protein  41.11 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  43.24 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  39.73 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  41 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1031  allophanate hydrolase subunit 2  41.18 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01082  putative carboxylase  39.2 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  34.84 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  34.84 
 
 		 329 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5123  hypothetical protein  40.92 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  35.48 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  33.77 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  38.16 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58515  hypothetical protein  40.26 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  34.42 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  34.42 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  33.55 
 
 		 329 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  34.09 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  34.09 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  34.85 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  37.93 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  35.26 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.45 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37310  hypothetical protein  41.2 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000804983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3201  hypothetical protein  40.4 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  35.25 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  36.03 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  37.68 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  35.49 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  35.6 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  33.87 
 
 		 345 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  34.08 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  34.32 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  34.32 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  34.32 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  34.11 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  34.32 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.32 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  34.1 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  32.06 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  36.27 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  32.06 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  35.82 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  34.22 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  34.1 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  33.66 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  34.1 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  34.1 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  34.1 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  33.66 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  34.32 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  33.11 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  33.66 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  32.7 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  35.17 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  33.33 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  31.72 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  35.89 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.15 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  34.15 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  34.15 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  33.33 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  35.49 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  34.08 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  34.43 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  31.39 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  36.21 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  31.39 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  34.43 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  34.51 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  34.12 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0378  urea amidolyase-related protein  33.33 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  34.1 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  34.1 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  34.48 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  32.04 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  32.04 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  34.02 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  34.1 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  36.09 
 
 		 347 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  35.4 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  31.99 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  32.14 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  32.14 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  32.14 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2593  urea amidolyase related protein  34.84 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>