286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1384 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  100 
 
 		 338 aa  660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  60.29 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  54.41 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  52.65 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  50.74 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  48.51 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  42.6 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  39.14 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  42.6 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  42.94 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  42.34 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  41.54 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  41.57 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  45.02 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  42.34 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  38.74 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  44.22 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  37.84 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  35.74 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  37.54 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  39.74 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  38.92 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  41.59 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  37.61 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  34.25 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  31.89 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  35.54 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  33.75 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  39.01 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  39.01 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  33.94 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  33.64 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  32.42 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.34 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  35.41 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  33.02 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  36.22 
 
 		 353 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  32.5 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  36.86 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  33.99 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  33.99 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  32.19 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  32.48 
 
 		 365 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  32.19 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  36.22 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  35.95 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  36.58 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  37.1 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  35.4 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  34.09 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  37.79 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.39 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  37.54 
 
 		 339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  36.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  29.94 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  36.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.55 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  34.32 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.78 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.78 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.78 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  37.79 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  38.61 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  34.23 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  35.57 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  33.33 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  33.55 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  33.33 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2273  urea amidolyase related protein  38.13 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  33.33 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  33.12 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  33.55 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  33.55 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  30.89 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  30.89 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  33.12 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  33.12 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  33.12 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  33.12 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  33.89 
 
 		 310 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  33 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7658  hypothetical protein  34.53 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  36.13 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  38.33 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  29.3 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  31.94 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  28.98 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0007  urea amidolyase related protein  34.54 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0026  allophanate hydrolase, subunit 2  35.35 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  36.08 
 
 		 353 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  34.04 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  34.46 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  34.36 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>