286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1505 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1505  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 353 aa  685    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5816  urea amidolyase related protein  47.37 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174826  normal  0.0709434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  38.39 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  36.09 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0520  urea amidolyase related protein  42.43 
 
 		 350 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  41.85 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  40.44 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  38.55 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  40.36 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2833  allophanate hydrolase subunit 2  41.8 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636901  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1815  urea amidolyase related protein  42.57 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2635  allophanate hydrolase subunit 2  41.25 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238129  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0709  urea amidolyase related protein  41.23 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0199666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  39.94 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1535  urea amidolyase related protein  41.21 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  36.86 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  36.75 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  36.56 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  36.25 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  36.47 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  34.38 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  36.76 
 
 		 329 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  36.88 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2957  urea amidolyase related protein  42.11 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  36.88 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  41.85 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  40.23 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  37.88 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  39.94 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1502  allophanate hydrolase subunit 2  39.13 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  36.64 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  36.06 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2623  allophanate hydrolase subunit 2  42.41 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2041  allophanate hydrolase subunit 2  40.78 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1495  urea amidolyase related protein  43.18 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0419081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  38.51 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3394  urea amidolyase related protein  41.56 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0656137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  33.77 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  33.77 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  43.25 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  38.55 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  36.05 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1708  urea amidolyase related protein  43.49 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0203426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3142  urea amidolyase related protein  37.61 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  32.91 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  32.91 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  37.61 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  40.62 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  37 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  37.16 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1105  urea amidolyase related protein  39.04 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0170901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  36.76 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2133  urea amidolyase related protein  39.58 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  38.78 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  36.47 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1985  allophanate hydrolase domain-containing protein  34.29 
 
 		 322 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.83 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.83 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3431  urea amidolyase related protein  39.13 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  37.22 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  38.11 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  36.62 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  41.14 
 
 		 345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  36.3 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  36.18 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1384  urea amidolyase related protein  36.08 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.669414 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  36.18 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4581  urea amidolyase related protein  37.12 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2804  allophanate hydrolase subunit 2  34.3 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.776372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  36.25 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  36.69 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  37.8 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1977  urea amidolyase related protein  35.74 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0301643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2934  urea amidolyase-related protein  36.97 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2720  Urea amidolyase-related protein  37.27 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592152  normal  0.72713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  36.25 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  37.23 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3590  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  35.92 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  34.5 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3354  urea amidolyase related protein  40.07 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  33.03 
 
 		 1208 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06480  putative hydrolase  37.27 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000202222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  37.16 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  35.09 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  38.57 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4096  urea amidolyase related protein  37.79 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.288136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3875  urea amidolyase related protein  37.9 
 
 		 305 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  40.97 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  34.77 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  37.05 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  34.77 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  35.86 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>