More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4202 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4202  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.337989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1055  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.49 
 
 
337 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266615  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0428  alcohol dehydrogenase  47.55 
 
 
334 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02530  predicted NADP-dependent oxidoreductase  48.94 
 
 
332 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0491149  normal  0.895622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3134  alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374024  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1518  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
331 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0829184  normal  0.0167196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1684  alcohol dehydrogenase  43.69 
 
 
337 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1585  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
331 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114628  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1596  alcohol dehydrogenase  44.24 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1647  alcohol dehydrogenase  44 
 
 
337 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.213204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2754  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.63 
 
 
333 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1781  putative NADP-dependent oxidoreductase protein  44.71 
 
 
340 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2696  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.38 
 
 
337 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0118604  hitchhiker  0.0000828199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1579  alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 
331 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0936386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1662  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
337 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1037  alcohol dehydrogenase  46.32 
 
 
332 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377223  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1098  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
341 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.874931  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0539  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.88 
 
 
334 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000493623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2355  alcohol dehydrogenase  46.39 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1846  alcohol dehydrogenase  44.78 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2622  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
332 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00523973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3364  alcohol dehydrogenase  42.12 
 
 
332 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.357267  normal  0.197117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2269  putative NADP-dependent oxidoreductase  45.71 
 
 
332 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2491  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1933  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.92 
 
 
332 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781378  normal  0.639986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3362  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
339 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.540446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2917  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.81 
 
 
338 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1412  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.33 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3414  alcohol dehydrogenase  45.9 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2563  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2148  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2006  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.17413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3188  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 
334 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.692541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1697  alcohol dehydrogenase  44.11 
 
 
338 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.781815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2565  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 
338 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164505  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1209  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.87 
 
 
339 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000799112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1375  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 
332 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.791801  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0979  alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
331 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2871  alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 
338 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.390651  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1876  putative oxidoreductase  45.51 
 
 
337 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0365812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7917  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.51 
 
 
349 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.615076 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2287  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.85 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2449  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1195  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3382  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.490383  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1922  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  45.85 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1808  alcohol dehydrogenase  45.4 
 
 
332 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5327  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  43.03 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1440  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.77 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1481  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.47 
 
 
336 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634045  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2326  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.85 
 
 
332 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0803814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.18 
 
 
344 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3317  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.95 
 
 
336 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1766  NADP-dependent oxidoreductase protein  44.24 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1136  alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 
341 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15930  predicted NADP-dependent oxidoreductase  42.81 
 
 
336 aa  238  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287644  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3459  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
339 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11258  YfmJ  38.14 
 
 
331 aa  235  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.780208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
334 aa  235  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17140  predicted NADP-dependent oxidoreductase  42.94 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0314613  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1849  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25360  predicted NADP-dependent oxidoreductase  43.87 
 
 
339 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.50036  normal  0.987423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1158  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.11 
 
 
338 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0373  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.72 
 
 
334 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.317567  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2218  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
333 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2257  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
333 aa  226  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6896  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.8 
 
 
346 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00938562  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2773  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.96 
 
 
341 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.229175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.39 
 
 
332 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2029  oxidoreductase, zinc-binding protein  38.97 
 
 
386 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1442  putative oxidoreductase/dehydrogenase  42.64 
 
 
340 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17984  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05194  oxidoreductase  38.51 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1424  alcohol dehydrogenase  38.84 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.349686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3624  oxidoreductase  38.97 
 
 
334 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
337 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.45 
 
 
343 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.555939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1816  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.23 
 
 
333 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110809  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0105  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.33 
 
 
337 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.320434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1395  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
333 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2102  alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
346 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1837  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 
335 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.455251  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.94 
 
 
345 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0432  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.34 
 
 
345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3895  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0873221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1070  alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 
339 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1723  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.7 
 
 
345 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000837186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4455  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00875354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3535  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.04 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1535  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.4 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2210  alcohol dehydrogenase  39.4 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.904335  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3719  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4558  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3805  alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2179  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.67 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01406  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  39.4 
 
 
345 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01417  hypothetical protein  39.4 
 
 
345 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3852  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.3 
 
 
339 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.291549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03275  quinone oxidoreductase  38.55 
 
 
342 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>