201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2050 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 450 aa  910    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  30.31 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  32.24 
 
 		 346 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  31.78 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  27.71 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  29.46 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 		 362 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 		 344 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  28.98 
 
 		 362 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 		 361 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  28.88 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  30.51 
 
 		 368 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  30.08 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3076  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.986116  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  32.42 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  31.51 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  29.73 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  33.5 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1986  aminoglycoside phosphotransferase  29.83 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  31.17 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4518  aminoglycoside phosphotransferase  30.04 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  30.42 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  30.97 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  30.97 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  28.38 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  30.47 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  30.45 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  29.75 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  30.89 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4969  aminoglycoside phosphotransferase  31.3 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5057  aminoglycoside phosphotransferase  31.3 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5350  aminoglycoside phosphotransferase  31.3 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  32.49 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.22 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2027  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2073  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2629  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0566206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  28.78 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  27.42 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.46 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2960  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.84 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  26.39 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  29.82 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  27.01 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1912  aminoglycoside phosphotransferase  26.33 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  32.9 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5603  aminoglycoside phosphotransferase  29.69 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1204  aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 340 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  28.34 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  28.1 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  29.71 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  30.41 
 
 		 353 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  24.42 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  26.75 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  26.8 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  28.95 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  29.07 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>