More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  56.06 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  57.38 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0187  ABC transporter related protein  58.99 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0675  ABC transporter related  56.29 
 
 		 285 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.29 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  53.68 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  45.52 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  42.16 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  40.43 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  39.58 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2570  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 292 aa  231  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402898  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3110  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1205  ABC transporter-like protein  43.8 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2656  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2907  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2633  ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.022138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0485  ABC transporter related  44.17 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2944  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.43 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000678463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4732  ABC transporter related  36.97 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2707  ABC transporter ATP-binding protein  42.55 
 
 		 238 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.239521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  36.49 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.91 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0701227  normal  0.5127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2711  ABC transporter related  39.18 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.483082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3322  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  36.71 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  39.07 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  34.53 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2267  ABC transporter related  40.15 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.14 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  27.78 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  33.49 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  30.25 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  34.84 
 
 		 226 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  30.56 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  31.6 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  27.4 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  31.02 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.86 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  27.71 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8885  ABC transporter related  31.73 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  36.24 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  34.74 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.74 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  26.17 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0948  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0386594  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1247  ABC transporter related  32.23 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.345861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  33.33 
 
 		 232 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  28.84 
 
 		 232 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.91 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  33.46 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3354  ABC transporter related  30.9 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02930  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.28 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6370  ABC transporter related  34.84 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1280  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 		 232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 232 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.68 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  25.31 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  31.28 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  31.32 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  30.21 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  31.71 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  31.32 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.85 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  28.44 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  28.7 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  27.9 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  33.97 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 236 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  27.09 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.09 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 		 232 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  31.56 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>