More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07150  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 313 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1005  PfkB domain protein  55.48 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3279  PfkB domain protein  57.14 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  36.09 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  38.02 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  36.1 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  34.75 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.49 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  34.78 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  35.61 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  35.46 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.28 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  36.27 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  36.27 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  35.62 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.81 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.99 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  32.89 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.44 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.62 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.33 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.62 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  26.75 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.93 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.32 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.8 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.3 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  35.11 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.33 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.69 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  33.11 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  27.6 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.3 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  28.53 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  28.53 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.43 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  24.37 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  24.37 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  24.37 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  31.37 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.35 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.21 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  33.89 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.21 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.12 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.12 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  27.1 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.06 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.31 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  35.62 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  35.62 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  25.77 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  23.76 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  26.45 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.06 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  26.77 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.67 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  25.49 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.09 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.38 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.57 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  23.25 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  23.92 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  20.98 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>