More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1150 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  9e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  48.51 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  45.86 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  42.98 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  44.7 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  43.07 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  41.61 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  40.88 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  40.44 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  38.64 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  37.68 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  39.81 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  39.81 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.94 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  37.29 
 
 		 184 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  34.88 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.5 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  34.4 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  34.29 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  34.59 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  35.54 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  44.44 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.22 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  29.85 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  44.3 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  33.94 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  30.33 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  35.58 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  35 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  33.98 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  40.66 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  30.99 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  34.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  36.75 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  39.18 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  34.26 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.47 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  35.65 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  35.4 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  33.03 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  29.85 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  38.14 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  34.55 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  39.73 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  30.6 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  38.68 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  30.77 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.08 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  40.22 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  36.36 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  43.59 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  39.8 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2440  ATPase  32.46 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  32.54 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  33.62 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  35.11 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  32.12 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  35.11 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  33.65 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  28.57 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  35 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  37.63 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  34.72 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  39.02 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  38.3 
 
 		 504 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  29.69 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0117  protein of unknown function UPF0079  32.59 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  35.92 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  38.61 
 
 		 503 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  32.03 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  33.88 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  29.5 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 		 540 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  37.62 
 
 		 505 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  26.67 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  29.82 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  34.02 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  35.14 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  31.53 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  34.17 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.17 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  37.27 
 
 		 506 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  31.86 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0902  hypothetical protein  31.3 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.336942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>