More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0117 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0117  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  29.08 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  33.6 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  33.06 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  34.02 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  32.73 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  29.25 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  35.96 
 
 
497 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.48 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.93 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  33.93 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  33.93 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  30.89 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  33.93 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  30.89 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  37.84 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  37.23 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.04 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  33.93 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  34.86 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  33.93 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  31.08 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  33.93 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  35.45 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  29.73 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  34.94 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  28.95 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  38.04 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.59 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  32.56 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  31.91 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  28.79 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  33.03 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  28.79 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  31.68 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  24.56 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  25.45 
 
 
169 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  25.2 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  31.18 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  30.09 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  26.28 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  40.71 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  34.88 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  34.07 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3434  protein of unknown function UPF0079  27.62 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  30.09 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  31.36 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  31.36 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  34.48 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  34.65 
 
 
504 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  34.91 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  34.41 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  35.16 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  28.68 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  28.04 
 
 
176 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  29.82 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  27.73 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.14 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  30.97 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  30.3 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  30.97 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  29.41 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  37.93 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  28.7 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  32.08 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  29.63 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  33.65 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  32.97 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  29 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  41.25 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  25.93 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.47 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  25.69 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  29.41 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  31.82 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  38.82 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  32.94 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  34.48 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  32.94 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  30.63 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  32.94 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  32.94 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  32.94 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  32.94 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  32.94 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  30.63 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  32.94 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  30.63 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  32.94 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>