More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0266 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  48.06 
 
 
139 aa  120  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.4 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  39.01 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  39.01 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.11 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.58 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  31.47 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  33.1 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.11 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  29.71 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.12 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  32.41 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  32.41 
 
 
152 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  35.61 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.61 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  32.31 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.45 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.45 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.03 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  31.11 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  35.45 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.45 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.45 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  34.86 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  32.82 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.71 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  31.11 
 
 
189 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.11 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  29.08 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  32.09 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.32 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  38.32 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.51 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  35.51 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  32.84 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  37.14 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  32.81 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  36.15 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  40.48 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  34.23 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  30.51 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  36.03 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.62 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  35.24 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  29.82 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16710  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  31.03 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5126  hypothetical protein  36.79 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0575495  normal  0.912699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  32.41 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  33.94 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  34.07 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  40.48 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  35.42 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  28.89 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  33.63 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  32.41 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  30.84 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  30.84 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  30.84 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  29.1 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  33.63 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  42.05 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2004  hypothetical protein  32.17 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  33.06 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  33.06 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  33.33 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  32.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  27.48 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  30.6 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0357  hypothetical protein  28.29 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.0878506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  28.46 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  35.25 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  33.01 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  35.82 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0053  hypothetical protein  33.04 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2895  hypothetical protein  30.51 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  35.71 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4265  protein of unknown function UPF0079  38.2 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  27.08 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00412  hypothetical protein  28.89 
 
 
166 aa  67  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  32.67 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>