More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1492 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  39.44 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  38.41 
 
 
161 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  37.68 
 
 
161 aa  111  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1524  hypothetical protein  40.15 
 
 
159 aa  96.3  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.535681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  43.94 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  32.23 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  32.23 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  32.23 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  34.31 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  38.46 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.81 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  35.56 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  34.07 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  32.82 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.81 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  34.07 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  36.84 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.41 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  37.04 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  32.56 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  43.08 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  30.53 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35.48 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  31.54 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.87 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  37.88 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  37.88 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  42.45 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  29.84 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  32.41 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.22 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  36.52 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  32.81 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.29 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0936  hypothetical protein  42.11 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000264552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  28.91 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  31.51 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  30.7 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  34.71 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  38.89 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35.94 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  32.77 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  33.65 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  32.2 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  34.62 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.39 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  36.07 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  33.9 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  39.18 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  39.18 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2599  protein of unknown function UPF0079  31.97 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.063881  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  30.6 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  38.18 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3072  protein of unknown function UPF0079  29.17 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.351219  normal  0.508247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0918  hypothetical protein  29.36 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  30.39 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  30.39 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  30.39 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  28.15 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  33.61 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  34.43 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  33.65 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  32.46 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  33.61 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  36.79 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  33.64 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  32.43 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  31.67 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  30.3 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  28.57 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  36.94 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  36.63 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1496  hypothetical protein  31.91 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00826257  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  34.31 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  38.52 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1260  protein of unknown function UPF0079  33.6 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  34.48 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  29.13 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  35.71 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  29.6 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0729  protein of unknown function UPF0079  30.7 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00214278  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  30.63 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  39.58 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2605  protein of unknown function UPF0079  32.03 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  34.52 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>