More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2777 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  65.2 
 
 		 296 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  59.93 
 
 		 300 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  54.64 
 
 		 316 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  56.9 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  54.48 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  52.92 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  53.24 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  53.02 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  56.4 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  53.33 
 
 		 319 aa  278  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  40.26 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  36.08 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  36.55 
 
 		 286 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  41.84 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  36.36 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  32.89 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  36.88 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  35.12 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  34.75 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  36.52 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  32.89 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  33.45 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.99 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  27.76 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  29.27 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  31.25 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  32.64 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  35.87 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  29.05 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  29.47 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  27.37 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  26.92 
 
 		 348 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  27.6 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  30.91 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  28.06 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.86 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  22.99 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  25.4 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.17 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.68 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  28.62 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  28.83 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.99 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  51.56 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.31 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.79 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  23.79 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.21 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  27.96 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.04 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  22.57 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  30.15 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.37 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  20.39 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  25.58 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  27.47 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>