More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1038 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3322  hypothetical protein  44.93 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.985105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  41.58 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0627  coenzyme F390 synthetase  33.41 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.84 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.92 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  28.67 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.33 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  25.49 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  29.49 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  27.07 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  28.35 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.65 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  26.92 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.38 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  27.62 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  24.35 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  23.94 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  28.37 
 
 		 438 aa  93.6  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2689  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.15 
 
 		 438 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0708257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  26.34 
 
 		 445 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  28.81 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.21 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  27.77 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  26.8 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.28 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 434 aa  90.1  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  27.66 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  28.25 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.68 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  25.57 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  28.5 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  25.57 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  27.68 
 
 		 433 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  28.93 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  26.29 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  27.27 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  29.23 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  26.49 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  27.07 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.77 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  26.82 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  25.45 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  25.11 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.63 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  25.98 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.04 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.7 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  26.18 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  27.7 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  25.39 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  27.19 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.46 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  26.09 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  26.7 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  25.4 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.95 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  25.44 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.13 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  27.01 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  26.99 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  27.46 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  25.78 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  26.65 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  27.34 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  25.14 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  26.3 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  27.03 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  26.94 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  24.6 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.11 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.35 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  23.5 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  22.98 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  27.76 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  28.57 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  27 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  24.66 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  26.35 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.97 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  24.86 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  26.32 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  26.68 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  28.12 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  24.89 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0929  phenylacetate-coenzyme A ligase (phenylacetyl-CoA ligase) (PA-CoA ligase)  43.48 
 
 		 129 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  24.49 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>