More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1070 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0660  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1936  transcriptional regulator, DeoR family  43.2 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000701948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.08 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.17 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  30.77 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.9 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.1 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.1 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  28.07 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  24.7 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.5 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.5 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.5 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.34 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  25.5 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  27.17 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.89 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 315 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  26.64 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  28.45 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  28.45 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 376 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.13 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.13 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.04 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.7 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.26 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  28.8 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.13 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  29.13 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.45 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  29.91 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  27.34 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  26.5 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  26.5 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  28.45 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.34 
 
 		 314 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  29.44 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  27.16 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  26.8 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  26.27 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.27 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  26.07 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  26.05 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  24.79 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  29.96 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  27.27 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>