181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2866 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 135 aa  270  7e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.3 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 206 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2037  transcriptional regulator, PadR-like family  27.74 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  32.08 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  34.92 
 
 		 277 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  40.62 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 271 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 371 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  57  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  42.59 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  37.14 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  38.82 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  44.64 
 
 		 175 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 220 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.94 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  27.08 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  25.62 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 240 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 249 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 195 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  28.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  31.33 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  40.74 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>