35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2037 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2037  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.418536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  27.74 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  30.7 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  28.48 
 
 		 250 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 131 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  28.42 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  26.8 
 
 		 255 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  23.81 
 
 		 219 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 131 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 263 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  22.64 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>