More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0942 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  54.35 
 
 
279 aa  300  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  34.98 
 
 
250 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  30.13 
 
 
315 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  27.45 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  26.27 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  30.73 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.8 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  25.73 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  34.64 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.09 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.38 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.47 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  26.29 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.27 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  24.43 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  33.04 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  32.43 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  33.86 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.9 
 
 
185 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  33.85 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  27.17 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  28.35 
 
 
638 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 
131 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  23.21 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  28.14 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  38.58 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.14 
 
 
153 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  28.98 
 
 
907 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  24.45 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  22.65 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  30.61 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.63 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  30.16 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  33.33 
 
 
160 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.51 
 
 
488 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.36 
 
 
500 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.07 
 
 
211 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  24.71 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
859 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
162 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.91 
 
 
188 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
145 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  32.8 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.51 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  29.33 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.23 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  28.74 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.85 
 
 
166 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  28.3 
 
 
382 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
162 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  25.86 
 
 
416 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.3 
 
 
489 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  25.15 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
145 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.25 
 
 
427 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  27.67 
 
 
382 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  27.76 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  29.1 
 
 
141 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  24.65 
 
 
423 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
146 aa  56.6  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
147 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
153 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
153 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32 
 
 
907 aa  55.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  32.2 
 
 
147 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2628  IMP dehydrogenase family protein  30.09 
 
 
479 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  23.32 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  25.54 
 
 
384 aa  55.8  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  33.33 
 
 
150 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 
141 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
215 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
145 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 
132 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  28.95 
 
 
143 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.26 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 
134 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  30.63 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  31.85 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  34.75 
 
 
487 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  28.57 
 
 
411 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  35.43 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.28 
 
 
202 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  24.86 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  29.91 
 
 
146 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>