108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2718 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  147  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2726  hypothetical protein  92.68 
 
 		 52 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.414252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  71.43 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  71.43 
 
 		 327 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  68.57 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  71.43 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  71.88 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  68.57 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  68.57 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  68.57 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  68.57 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  65.71 
 
 		 326 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  65.71 
 
 		 327 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  63.89 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  63.89 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  56.52 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  65.71 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  65.71 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  65.62 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  62.86 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  68.75 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  65.71 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  65.62 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  65.71 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  65.71 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  62.86 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  62.86 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  62.86 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  62.86 
 
 		 326 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  65.62 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  60 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  62.86 
 
 		 325 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  54.35 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  62.5 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  62.5 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  62.5 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  62.86 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  60 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  60 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  62.86 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  68.75 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  65.71 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  47.83 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  62.5 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  57.14 
 
 		 325 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  68.75 
 
 		 370 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.78 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  52.78 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3678  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1705  hypothetical protein  61.29 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  65.62 
 
 		 377 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  52.78 
 
 		 319 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  64.52 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  56.25 
 
 		 328 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  52.78 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  52.78 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  64.52 
 
 		 329 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  52.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  61.29 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  61.29 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  65.62 
 
 		 336 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  65.52 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  65.52 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  65.52 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  65.52 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  61.29 
 
 		 345 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  54.29 
 
 		 326 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  51.43 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  62.07 
 
 		 349 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  62.07 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  62.07 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  56.25 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  62.07 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  62.07 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  62.07 
 
 		 345 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  62.07 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  54.29 
 
 		 326 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  48.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  48.57 
 
 		 325 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  47.62 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>