51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1660 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  71.88 
 
 		 285 aa  427  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  66.18 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  43.05 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  33.22 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.66 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  30.77 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  29.58 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  29.17 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  24.81 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.39 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.37 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.91 
 
 		 673 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.9 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.67 
 
 		 641 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  24.63 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  34.41 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 813 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.13 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  21.19 
 
 		 704 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.14 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.13 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  26.06 
 
 		 757 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 631 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.27 
 
 		 643 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  38.81 
 
 		 903 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 		 537 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.73 
 
 		 656 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  25.28 
 
 		 673 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.07 
 
 		 658 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  24.19 
 
 		 665 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  23.98 
 
 		 670 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.84 
 
 		 509 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 		 666 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  34.67 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  28.06 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 613 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 		 638 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  31.96 
 
 		 653 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.44 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  28.04 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 650 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  30.99 
 
 		 712 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  34.33 
 
 		 679 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  26.9 
 
 		 761 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.14 
 
 		 734 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  25.56 
 
 		 586 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  27.47 
 
 		 471 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>