174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0823 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  68.72 
 
 		 175 aa  245  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  56.14 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  59.52 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  61.59 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  58.72 
 
 		 174 aa  191  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  58.33 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  52.81 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  57.06 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  56.8 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  56.8 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  56.8 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  58.11 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  50.98 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  41.28 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  41.35 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  40.27 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  35 
 
 		 212 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  45.38 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  43.55 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  42.11 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  44.54 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  37.72 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  44.07 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  35.19 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  41.03 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  45.3 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  40.88 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  37.13 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  35.19 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  37.8 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  34.48 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  40 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  41.53 
 
 		 200 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 200 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 200 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  41.94 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  33.77 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  37.93 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  40.94 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  40.94 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  33.95 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  37.98 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  30.67 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  32.43 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  31.79 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  31.93 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.82 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.82 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  29.45 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  29.45 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  28.95 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.86 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.68 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  29.82 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  29.65 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  29.34 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  29.38 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  28.49 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  29.68 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.12 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  28.46 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  28.14 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  28.65 
 
 		 286 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  27.69 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  25.75 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  35.8 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.69 
 
 		 258 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  26.45 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  29.19 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>