More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6293 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  73.14 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  74.79 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  71.9 
 
 		 261 aa  362  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  71.49 
 
 		 251 aa  361  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  72.31 
 
 		 249 aa  361  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.31 
 
 		 257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  73.14 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  71.49 
 
 		 251 aa  357  7e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  71.07 
 
 		 259 aa  357  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  69.83 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  69.01 
 
 		 270 aa  354  5.999999999999999e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  71.07 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  69.42 
 
 		 256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  70.66 
 
 		 247 aa  350  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 256 aa  349  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  70.25 
 
 		 254 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  70.25 
 
 		 254 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  70.25 
 
 		 242 aa  348  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  69.01 
 
 		 255 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  70.66 
 
 		 257 aa  344  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  73.55 
 
 		 280 aa  343  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  69.42 
 
 		 244 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  68.6 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  69.42 
 
 		 251 aa  340  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  69.83 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  68.6 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  68.6 
 
 		 248 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.03 
 
 		 274 aa  339  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  69.07 
 
 		 251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.21 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  71.07 
 
 		 264 aa  335  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  63.33 
 
 		 260 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.33 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  63.33 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  64.05 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  64.41 
 
 		 259 aa  321  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  65.42 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  61.85 
 
 		 252 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.57 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.57 
 
 		 255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60.33 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  63.64 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  62.08 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  64.88 
 
 		 245 aa  314  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.05 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 		 251 aa  312  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  64.46 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.92 
 
 		 263 aa  311  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.5 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.51 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.09 
 
 		 249 aa  311  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  62.92 
 
 		 244 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  58.92 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  57.68 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  57.68 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  62.08 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.83 
 
 		 268 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  62.08 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  60.58 
 
 		 251 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  59.83 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 269 aa  307  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  64.2 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  60.83 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  58.26 
 
 		 249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  59.92 
 
 		 253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.51 
 
 		 263 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  60.74 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  61.41 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  57.68 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.41 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  59.41 
 
 		 258 aa  305  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  59.92 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.5 
 
 		 248 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.44 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  60.82 
 
 		 248 aa  304  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  60.83 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  60 
 
 		 249 aa  304  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.5 
 
 		 267 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  60.42 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.41 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.34 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  61.09 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  59.09 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  58.75 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>