232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5546 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4763  YCII-related protein  57.25 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  56.25 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  46.15 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4747  YCII-related protein  45.04 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3821  hypothetical protein  46.97 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.076371  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0245  hypothetical protein  44.7 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0858  hypothetical protein  46.97 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.11549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4325  DGPFAETKE family protein  44.7 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1915  YCII-related protein  44.7 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191468  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4403  DGPFAETKE family protein  44.27 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3868  DGPFAETKE family protein  45.74 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.986705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2428  YCII-related protein  42.54 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2611  DGPFAETKE family protein  43.08 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.089181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5674  DGPFAETKE family protein  45.04 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2918  DGPFAETKE family protein  42.75 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5295  DGPFAETKE domain-containing protein  43.08 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5384  DGPFAETKE family protein  43.08 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19350  hypothetical protein  43.85 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.187052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4307  YCII-related protein  42.42 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0153899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1985  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1262  YCII-related protein  39.84 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4760  YCII-related protein  40.91 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000445708  hitchhiker  0.000508919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  44.14 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  42.86 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  41.41 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  41.41 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  40.16 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3707  YCII-related protein  36.51 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  41.18 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  38.89 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2715  DGPFAETKE family protein  39.84 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.651883  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5460  hypothetical protein  42.31 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.382977  normal  0.0527528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  36.8 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4343  YCII-related protein  38.46 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.467101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6623  DGPFAETKE family protein  39.39 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  39.06 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1884  YCII-related protein  34.4 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110578  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3136  YCII-related protein  40.7 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  39.84 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.1 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  41.73 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0383  YCII-related protein  36.89 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4128  YCII-related protein  31.82 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  40.8 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  35.46 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  33.33 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1110  DGPFAETKE family protein  36.84 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  38.89 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  38.89 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  37.6 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  33.87 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36.22 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  34.81 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  35.43 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  42.11 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1298  DGPFAETKE family protein  36.27 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  43.02 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  38.89 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0074  YCII-related protein  40 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.888616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  34.92 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  32.59 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  36.19 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.71 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.42 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  38.39 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2719  DGPFAETKE family protein  39 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.945599  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  39.13 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  36.56 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  31.25 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  34.43 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  32.8 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  31.11 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4260  DGPF protein  35.29 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  37.62 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8876  YCII-related protein  36.79 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  35.85 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  32.06 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  40.7 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  34.91 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  31.97 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  31.97 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  31.97 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  31.15 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  36.96 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  31.5 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  30.4 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  31.15 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  34.58 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  31.15 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.74 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4161  hypothetical protein  34.31 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.78704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3127  YCII-related  33.68 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  37.25 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>