More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2929 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  100 
 
 		 590 aa  1156    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.41 
 
 		 635 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  66.1 
 
 		 614 aa  780    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  59.51 
 
 		 620 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 590 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  72.77 
 
 		 609 aa  791    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  61.54 
 
 		 588 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  71.92 
 
 		 600 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  66.1 
 
 		 615 aa  771    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  62.52 
 
 		 609 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  58.33 
 
 		 602 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  61.27 
 
 		 593 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  61.41 
 
 		 589 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 595 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.56 
 
 		 618 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.09 
 
 		 626 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  55.03 
 
 		 593 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  57.79 
 
 		 581 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 616 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  49.06 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.55 
 
 		 1257 aa  330  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  38.04 
 
 		 610 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  38.04 
 
 		 610 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  38.22 
 
 		 610 aa  329  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  37.43 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.27 
 
 		 984 aa  323  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 614 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.01 
 
 		 617 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  38.91 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 1218 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  38.36 
 
 		 1522 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.98 
 
 		 597 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 		 606 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  37.04 
 
 		 615 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 615 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  37.84 
 
 		 1301 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  40.7 
 
 		 1436 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.15 
 
 		 608 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.66 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  32.45 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.53 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.53 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.02 
 
 		 1284 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  30.54 
 
 		 589 aa  290  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  34.94 
 
 		 592 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.75 
 
 		 587 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  29.93 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  37.2 
 
 		 594 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.73 
 
 		 572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.79 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.2 
 
 		 1321 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  32.36 
 
 		 619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.61 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  37.35 
 
 		 634 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.99 
 
 		 598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.88 
 
 		 614 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.88 
 
 		 587 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.16 
 
 		 571 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.03 
 
 		 598 aa  283  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.69 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.69 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.69 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.13 
 
 		 623 aa  282  1e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.02 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.82 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.69 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 		 773 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.38 
 
 		 764 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.17 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.05 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 571 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.64 
 
 		 637 aa  279  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.1 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.31 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.65 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 600 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.58 
 
 		 566 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.83 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.51 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.31 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.51 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.31 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.51 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.1 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  36.27 
 
 		 652 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.31 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.31 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.34 
 
 		 571 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.5 
 
 		 598 aa  277  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 572 aa  277  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  34.79 
 
 		 602 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 572 aa  277  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  32.33 
 
 		 590 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  35.94 
 
 		 610 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.76 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.14 
 
 		 591 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.07 
 
 		 572 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  34.06 
 
 		 619 aa  276  7e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  38.22 
 
 		 582 aa  276  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>