More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1627 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 168 aa  343  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 168 aa  309  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  40.62 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  36.97 
 
 		 222 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  38.12 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  39.38 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  38.01 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  38.32 
 
 		 178 aa  94  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 210 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35.33 
 
 		 200 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 177 aa  90.9  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  33.89 
 
 		 242 aa  84.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  34.32 
 
 		 202 aa  84.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  36.48 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.72 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  32.21 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  31.1 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.91 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.01 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  28.82 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  34.69 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  32.69 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  30.54 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  32.67 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  27.81 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  27.87 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  32.84 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  31.15 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  28.03 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  26.29 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  35.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  35.65 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  43.59 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 277 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  47.76 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  31.74 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 242 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  28.45 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  31.9 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  33.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40.79 
 
 		 263 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  28.12 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  28.24 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>