More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1536 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 307 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 158 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 162 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  40.88 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  43.07 
 
 		 159 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.07 
 
 		 188 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 158 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 160 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 150 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  41.6 
 
 		 157 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 149 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  37.16 
 
 		 157 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 157 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 167 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 170 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  36.42 
 
 		 153 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  40.41 
 
 		 176 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36 
 
 		 162 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 163 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  37.82 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  33.1 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  38.69 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  34.27 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  38.73 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  38.4 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  32.24 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  38.89 
 
 		 177 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 209 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  39.82 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  31.03 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.4 
 
 		 178 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.4 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 156 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.4 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  43.93 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  38.1 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  43.93 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  34.81 
 
 		 146 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  43.93 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  43.93 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  37.12 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  37.12 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 169 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  32.54 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  32.14 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  34.07 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  35.51 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0510  HxlR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.356767  normal  0.463662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  40.57 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  29.01 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 149 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>