174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1057 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  100 
 
 
243 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  86.78 
 
 
260 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  76.25 
 
 
272 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  50.22 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  37.05 
 
 
237 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  37.66 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  31.3 
 
 
251 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
519 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
531 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
527 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
527 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  26.05 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  44.32 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.72 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.52 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  32.37 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  32.37 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  32.37 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  33.57 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.23 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24.41 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  26.98 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  30.43 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  29.1 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  30.6 
 
 
311 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  35.21 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  23.44 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25.1 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
711 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  27.57 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
710 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1390  SAM-binding motif-containing protein  38.03 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.671564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.61 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  27.1 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  29.91 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.15 
 
 
243 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  29.47 
 
 
261 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  27.89 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  28.17 
 
 
407 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  27.1 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  25.21 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.91 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  28.06 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
581 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  32.26 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  27.03 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 
324 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  24.87 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 
373 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  33 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
810 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
305 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  24.74 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  36.49 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
261 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  29.92 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.68 
 
 
255 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  27.54 
 
 
275 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  24.82 
 
 
258 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>