284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0795 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  73.02 
 
 
212 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  57.14 
 
 
221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  45.13 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  42.06 
 
 
213 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 
238 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  44.97 
 
 
221 aa  141  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  43.94 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  40.49 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 
238 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 
238 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  42.33 
 
 
238 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  42.41 
 
 
235 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 
251 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  37.73 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  41.55 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  40.53 
 
 
213 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  40 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  42.02 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  36.92 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  40.84 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  40.1 
 
 
236 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  40.44 
 
 
225 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  41.09 
 
 
227 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 
207 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  42.78 
 
 
224 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  37.31 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  37.73 
 
 
221 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  37.79 
 
 
233 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3792  lipoate-protein ligase B  41.57 
 
 
205 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  39.8 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  36.89 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  36.74 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  34.16 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  39.35 
 
 
217 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 
212 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  35.12 
 
 
232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  35.85 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  42.02 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1638  lipoate-protein ligase B  34.39 
 
 
209 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00770043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  40.76 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  39.55 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  36 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  38.98 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  33.66 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.68 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 
234 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  36.72 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 
231 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 
205 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  37.71 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  39.2 
 
 
215 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  37.16 
 
 
214 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 
264 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  34.26 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  35.62 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  39.09 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.04 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  35.55 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  33.17 
 
 
229 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  34.98 
 
 
215 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  37.95 
 
 
224 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 
267 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  36.15 
 
 
243 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  37.82 
 
 
228 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  40.56 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  40.62 
 
 
214 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 
240 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  37.5 
 
 
244 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 
220 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  36.21 
 
 
216 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  34.46 
 
 
219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  36.46 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  34.7 
 
 
267 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  36.42 
 
 
219 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  37.99 
 
 
224 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1350  lipoate-protein ligase B  37.85 
 
 
242 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0666448  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  34.36 
 
 
244 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>