More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0682 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  100 
 
 
873 aa  1726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.35 
 
 
868 aa  312  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  30.99 
 
 
885 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 
885 aa  294  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.56 
 
 
887 aa  208  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.37 
 
 
891 aa  201  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.19 
 
 
903 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  27.23 
 
 
865 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  24.62 
 
 
871 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  24.49 
 
 
866 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  22.86 
 
 
868 aa  170  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25 
 
 
889 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  22.81 
 
 
890 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.96 
 
 
840 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  22.68 
 
 
868 aa  161  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  24.28 
 
 
874 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  27.76 
 
 
725 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  22.13 
 
 
868 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  22.49 
 
 
868 aa  159  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.11 
 
 
884 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  27.84 
 
 
708 aa  156  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  27.36 
 
 
871 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  26.1 
 
 
854 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  21.93 
 
 
825 aa  146  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.24 
 
 
902 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  30.43 
 
 
842 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  30.43 
 
 
842 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.47 
 
 
873 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
754 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  34 
 
 
971 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.13 
 
 
769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  27.81 
 
 
799 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 
780 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.15 
 
 
785 aa  115  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.12 
 
 
810 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  30.32 
 
 
788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.13 
 
 
852 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.75 
 
 
592 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
760 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.04 
 
 
867 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  28.61 
 
 
824 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
761 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.37 
 
 
826 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
785 aa  107  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 
758 aa  107  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  29.58 
 
 
762 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 
870 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 
782 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  30.45 
 
 
779 aa  105  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  31.89 
 
 
907 aa  105  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 
758 aa  105  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 
761 aa  104  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  28.09 
 
 
758 aa  104  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.43 
 
 
781 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  26.1 
 
 
764 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.06 
 
 
869 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32 
 
 
950 aa  103  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.23 
 
 
892 aa  102  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  32.78 
 
 
906 aa  100  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  25.16 
 
 
758 aa  100  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.15 
 
 
811 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  25.42 
 
 
791 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 
869 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  29.57 
 
 
891 aa  98.6  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.23 
 
 
868 aa  98.2  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  26.42 
 
 
758 aa  97.8  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 
869 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  25.81 
 
 
762 aa  97.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 
842 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  26.43 
 
 
757 aa  97.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.33 
 
 
887 aa  96.3  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  27.76 
 
 
794 aa  95.9  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 
799 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 
792 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  26.1 
 
 
758 aa  95.1  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  30.83 
 
 
790 aa  94.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 
786 aa  94.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 
760 aa  94  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  31.66 
 
 
791 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  31.66 
 
 
791 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  30.74 
 
 
790 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
791 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  25.47 
 
 
758 aa  94  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 
791 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
791 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 
791 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  23.02 
 
 
868 aa  93.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
765 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  23.02 
 
 
868 aa  93.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
791 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  31.66 
 
 
778 aa  91.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  29.25 
 
 
810 aa  91.3  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
798 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
798 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
798 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  23.64 
 
 
868 aa  90.5  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  35.74 
 
 
537 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  29.25 
 
 
809 aa  90.5  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  30.79 
 
 
275 aa  89.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  41.88 
 
 
797 aa  89.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>