More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  273  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  65.62 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  40.15 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.82 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.65 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.85 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  37.07 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.9 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  32.31 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  33 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  32.82 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.82 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  32.06 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.93 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>