60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2466 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1119    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  75.4 
 
 		 569 aa  832    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  75.71 
 
 		 564 aa  852    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  73.1 
 
 		 555 aa  808    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  74.19 
 
 		 553 aa  830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  76.24 
 
 		 564 aa  834    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  75.18 
 
 		 553 aa  837    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  74.41 
 
 		 552 aa  831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  76.06 
 
 		 564 aa  835    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  58.56 
 
 		 544 aa  608  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  53.78 
 
 		 548 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  55.38 
 
 		 544 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  53.8 
 
 		 544 aa  594  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  53.83 
 
 		 546 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  49.49 
 
 		 586 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  48.16 
 
 		 540 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  37.12 
 
 		 584 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  39.06 
 
 		 581 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  38.59 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  32.38 
 
 		 555 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  26.59 
 
 		 568 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  29.18 
 
 		 595 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  27.87 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  27.75 
 
 		 580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  26.24 
 
 		 548 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.09 
 
 		 543 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  27.09 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  26.13 
 
 		 543 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  26.63 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  26.13 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  28.49 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  26.77 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  25.4 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  26.44 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  26.23 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  26.84 
 
 		 544 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  26.86 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  25.95 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  25.75 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.91 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  27.85 
 
 		 566 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  28.04 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.8 
 
 		 611 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.57 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  26.42 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  23.5 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  20.27 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  26.7 
 
 		 438 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.86 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  24.12 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  24.1 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  24.07 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  25.07 
 
 		 871 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  27.74 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  23.87 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_002950  PG1585  batD protein  22.73 
 
 		 600 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  20.85 
 
 		 447 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1010  hypothetical protein  20.91 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.456603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  24.07 
 
 		 414 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>