More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0824 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  85.94 
 
 
256 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  83.52 
 
 
261 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  49.61 
 
 
255 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  48.97 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  54.3 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
285 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  51.82 
 
 
285 aa  221  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  51.82 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  47.83 
 
 
252 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  40.27 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  41.18 
 
 
278 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 
244 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  34.9 
 
 
271 aa  151  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  38.8 
 
 
246 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.66 
 
 
251 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  35.34 
 
 
246 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  35.34 
 
 
247 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
269 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
248 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 
250 aa  142  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  38.12 
 
 
248 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  36.52 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
246 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  35.08 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  35.32 
 
 
501 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 
246 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.78 
 
 
263 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  32.4 
 
 
243 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.07 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
513 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
264 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.27 
 
 
248 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  35.84 
 
 
266 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 
270 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
247 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.62 
 
 
260 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.4 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  36.56 
 
 
257 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.44 
 
 
248 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.85 
 
 
248 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
264 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.02 
 
 
248 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.26 
 
 
480 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
254 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 
253 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.41 
 
 
253 aa  121  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
260 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.02 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 
247 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  32.37 
 
 
736 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.83 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 
247 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.04 
 
 
281 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
257 aa  118  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34 
 
 
247 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3387  extracellular solute-binding protein family 3  38.1 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  33.79 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  33.79 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  31.54 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  30.52 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  30.52 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  30.52 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  30.52 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 
265 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  30.49 
 
 
264 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.73 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  35.68 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.49 
 
 
264 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 
253 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
252 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  31.15 
 
 
264 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  36.16 
 
 
282 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
253 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>