86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0740 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  100 
 
 		 399 aa  792    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  75.94 
 
 		 393 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  75.69 
 
 		 393 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  75.69 
 
 		 393 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  69.97 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  69.97 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  69.97 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  69.97 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  69.97 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  70.48 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  69.97 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  62.34 
 
 		 360 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  63.66 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  55.56 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  54.2 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  54.06 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  56.35 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  54.34 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  53.05 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  53.05 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  53.05 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  53.3 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  54.69 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  52.86 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  52.86 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  52.86 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  52.86 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  52.79 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  52.86 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  52.86 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  52.59 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  52.04 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  52.3 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  52.3 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  51.2 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  34.41 
 
 		 371 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  31.62 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  30.88 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  30.5 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  30.65 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.55 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  41.27 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  22.62 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  23.21 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.35 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0998  putative permease  27.49 
 
 		 548 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1356  major facilitator family transporter  23 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  25.76 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  24.45 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.54 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1372  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 479 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>