More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0717 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.24 
 
 
204 aa  347  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  82.27 
 
 
204 aa  345  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.45 
 
 
230 aa  332  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.94 
 
 
204 aa  330  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  80.79 
 
 
222 aa  319  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  79.8 
 
 
204 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  79.31 
 
 
204 aa  313  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  74.51 
 
 
204 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  75 
 
 
204 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.37 
 
 
205 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 
205 aa  131  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.22 
 
 
210 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  35.26 
 
 
215 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  36.32 
 
 
205 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  34.72 
 
 
205 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 
208 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.36 
 
 
205 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  31.98 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  36.14 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  34.92 
 
 
212 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  35.6 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
204 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 
209 aa  117  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  31.28 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  33.5 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  35.87 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  35.29 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 
203 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
205 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  34.87 
 
 
203 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 
221 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 
203 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 
205 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  35.08 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.47 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.11 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  29.95 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  31.31 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  30.34 
 
 
219 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  30.34 
 
 
219 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  32.85 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  32.85 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  32.85 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  36.51 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 
228 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  32.67 
 
 
204 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
204 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.27 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  34.03 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.25 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  32.37 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  31.88 
 
 
206 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  31.88 
 
 
206 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  31.68 
 
 
204 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  32.18 
 
 
204 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 
203 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  32.85 
 
 
210 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  33.01 
 
 
206 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  33.86 
 
 
204 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  34.39 
 
 
210 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  32.63 
 
 
204 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
209 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  34.92 
 
 
210 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.92 
 
 
210 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
212 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  34.39 
 
 
210 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  34.39 
 
 
210 aa  104  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  34.39 
 
 
210 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  34.39 
 
 
210 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.13 
 
 
208 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  31.73 
 
 
210 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
205 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 
223 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  31.4 
 
 
206 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.88 
 
 
210 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
212 aa  101  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.8 
 
 
211 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  29.41 
 
 
212 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  30.43 
 
 
206 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  30.43 
 
 
206 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  30.43 
 
 
206 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  30.5 
 
 
206 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.69 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>