More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0334 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  100 
 
 		 418 aa  870    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  62.77 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  59.81 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  59.41 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  49.28 
 
 		 430 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  57.66 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  29.78 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  30.09 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  24 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  25.75 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  28.83 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  24.29 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  27.88 
 
 		 446 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  28.37 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  26.83 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  25.06 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  26.29 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  24.63 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  24.33 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  24.91 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  24.25 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  26.01 
 
 		 404 aa  87.4  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 430 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.68 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  22.97 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  25.3 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  26.57 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  27.78 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  29.01 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  24.78 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  24.73 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  24.75 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  27.36 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.71 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  24.28 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  27.78 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  26.79 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  24.21 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  25.62 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  22.7 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  25.17 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  22.99 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  25.44 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  27.62 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 465 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 466 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  25.35 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  24.82 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.74 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  25 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  23.26 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  22.56 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  25.77 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  26 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  26.67 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  25.27 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0731  histidine kinase  26.1 
 
 		 563 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.842876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  24.5 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2713  sensor histidine kinase  23.16 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.725712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  26.5 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  23.04 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1213  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  25.29 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  29.59 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  24.03 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>