More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2713 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2713  sensor histidine kinase  100 
 
 		 479 aa  969    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.725712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0799  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.81 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00386  putative sensor transduction kinase (copper resistance)  33.4 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0355  membrane associated sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 479 aa  256  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.75 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  25.57 
 
 		 497 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  28.82 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  22.43 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.37 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  22.82 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 473 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  21.78 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  24.94 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  23.13 
 
 		 431 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2713  histidine kinase  21.73 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  23.16 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 466 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  24.05 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 447 aa  94  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.7 
 
 		 470 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  24.64 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.45 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  23.93 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  24.26 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 350 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 469 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  23.37 
 
 		 443 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 466 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  22.96 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  23.2 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 461 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  24.1 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 486 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  25.57 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  26.64 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  24.71 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.08 
 
 		 446 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  19.74 
 
 		 462 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  23.79 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 582 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.87 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  20.92 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 456 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  22.9 
 
 		 486 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  23.21 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  20.71 
 
 		 465 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 482 aa  87  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 476 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  22.63 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  24.23 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  21.92 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  22.78 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>