46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6063 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  100 
 
 
524 aa  1085    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  48.47 
 
 
653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  33.01 
 
 
350 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  30.03 
 
 
353 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  31.72 
 
 
354 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  26.02 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  24.51 
 
 
423 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  26.03 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  26.42 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  27.18 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  24.81 
 
 
410 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  25.98 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  29.65 
 
 
413 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  30.54 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  25 
 
 
416 aa  57  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  27.5 
 
 
497 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  25.41 
 
 
455 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  32.12 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  25.86 
 
 
353 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 
1072 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  24.56 
 
 
1349 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  25.52 
 
 
291 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  25.27 
 
 
261 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  25.09 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  27.64 
 
 
469 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  23.59 
 
 
272 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
709 aa  47.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  31.71 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  24.19 
 
 
558 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  23.74 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.05 
 
 
801 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  31.82 
 
 
492 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  26.5 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  33.33 
 
 
803 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  23.67 
 
 
446 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.37 
 
 
794 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  29.06 
 
 
423 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  28.57 
 
 
479 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.89 
 
 
490 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.06 
 
 
568 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  27.35 
 
 
446 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  28.69 
 
 
494 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  25.08 
 
 
305 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001120  hypothetical protein  24.02 
 
 
297 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000254312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  27.69 
 
 
373 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>